注册三类医疗器械公司需要的证件有：营业执照副本原件；医疗器械经营许可证申请表；2名以上医学、器学从业人员的学历证明；组织机构设置说明等。

注册资金：第三类医疗器械经营公司没有要求。注册时间要看具体情况，注册的资质：先在营业执照上增加医疗器械相关范围，《二类医疗器械备案证明》。注册的流程：核名，提交资料，取得证照，刻制印章，开设企业对公账户，税务所登记。